Влияние гликолей на ферментативный синтез ДНК

Дипломная работа с практическими частями.

Тема: Влияние гликолей на ферментативный синтез ДНК.

Дипломная работа включает в себя: 57 страниц, введение, 3 раздела, заключение и 25 источников литературы.

Дополнительные материалы: презентация и речь.

ВВЕДЕНИЕ. 3

ГЛАВА 1. ТЕОРЕТИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ ГЛИКОЛЕЙ В ФЕРМЕНТАТИВНОМ СИНТЕЗЕ ДНК.. 5

  1.1. Ферментативный синтез и амплификация нуклеиновой кислоты.. 5

   1.2. Амплификация: ее сущность и предназначение. Способы улучшения амплификации. 9

   1.3. Исследуемые работы по амплификации. 26

1.4. Расчетная часть. 32

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.. 34

2.1. Объект исследования. 34

2.2. Методы и методики исследования. 38

2.3. Обработка результатов. 42

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЯ.. 46

3.1. Исследования влияния гликолей на ферментативную обработку. 46

3.2. Выводы и результаты.. 50

ЗАКЛЮЧЕНИЕ. 53

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ.. 55

1.            Берд Дж.Ф., Уэллс Р.Д. Влияние условий инкубации на нуклеотидную последовательность ДНК-продуктов непраймированных ДНК-полимеразных реакций // J. Mol. Биол. – 2020. – Т. 53. – С. 435–459.

2.            Бодулев О.Л., Сахаров И.Ю. Методы амплификации изотермических нуклеиновых кислот и их использование в биоанализе. // Биохимия (Москва). – 2021. Т. 85. № 2. – С. 147-166.

3.            Гилл П., Гаеми А. Технологии изотермической амплификации нуклеиновых кислот: обзор. // Нуклеозиды Нуклеотиды Нуклеиновые кислоты. – 2020. – Т. 27. № 3. – С. 224–243.

4.            Зубик А.Н., Рудницкая Г.Е., Евстрапов А.А. Изотермическая петлевая усилительная лампа в формате микроустройства (обзора) // Научное приборостроение. – 2021. – Т. 31. № 1. – С. 3–43.

5.            Зырина Н.В., Железная Л.А., Дворецкий Е.В., Васильев В.Д., Чернов А., Матвиенко Н.И., ДНК-никаза N.BspD6I сильно стимулирует матрично-независимый синтез непалиндромной повторяющейся ДНК Bst ДНК-полимеразой // Биол. хим. – 2021. – Т. 388. – С. 367–372.

6.            Иноуэ Дж., Сигэмори Й., Микава Т., Повышение эффективности и точности амплификации по катящемуся кругу (RCA) с использованием мутантного белка SSB Thermus thermophilus // Nucleic. Кислоты. Рез. – 2020. – Т. 34. – С. е69.

7.            Литусов, Н.В. Методы исследования в медицинской бактериологии: учеб. Пособие / Н.В. Литунов; Екатеринбург: Изд-во УГМУ, 2021. – 232 с.

8.            Лян Х., Дженсен К., Франк-Каменецкий М., Д., Очень эффективный синтез ДНК, независимый от матрицы/праймера, с помощью термофильной ДНК-полимеразы в присутствии термофильной эндонуклеазы рестрикции. // Биохимия. – 2021. – Т. 43. – С. 13459–13466.

9.            Комптон Дж. Амплификация на основе последовательностей нуклеиновых кислот // Природа. – 2021. – Т. 350. № 6313. – С. 91–92.

10.        Огата Н., Миура Т. (2020) Генетическая информация, «созданная» архебактериальной ДНК-полимеразой. // Биохим. Ж. – 2020. – Т. 324(Часть 2). – С. 667–671.

11.        Огата Н., Миура Т. Г. Создание генетической информации ДНК-полимеразой термофильной бактерии Thermus thermophilus // Нуклеик. Кислоты. Рез. – 2022. – Т. 26. – С. 4657–4661.

12.        Огата Н., Миура Т., Элонгация тандемной повторяющейся ДНК ДНК-полимеразой гипертермофильного Archaeon Thermococcuslitoralis в переходном состоянии «шпилька-спираль»: модель амплификации первичной простой последовательности ДНК // Биохимия. – 2020. – Т. 39. – С. 13993–14001.

13.        Огата Н., Морино Х. Элонгация повторяющейся ДНК ДНК-полимеразой гипертермофильной бактерии Thermus thermophilus // Nucleic. Кислоты. Рез.: – 2020. – Т. 28. – С. 3999–4004.

14.        Окадзаки Т. Корнберг А. Ферментативный синтез дезоксирибонуклеиновой кислоты. Хв. Очистка и свойства полимеразы Bacillus subtilis // J Biol Chem. – 2022. – Т. 239. – С. 259–268.

15.        Оно С. Эволюция от первичных олигомерных повторов к современным кодирующим последовательностям// J. Mol. Эво. – 2021. – Т. 125. – С. 325–329.

16.        Рамадан К., Шевелев И.В., Мага Г., Хубшер У. Синтез ДНК de novo человека ДНК-полимеразой лямбда, ДНК-полимеразой мю и терминальной дезоксирибонуклеотидилтрансферазой //. Дж Мол Биол. – 2021. – Т. 339. – С. 395–404.

17.        Тан Э., Эрвин Б., Дэймс С. и др. Специфическая и неспецифическая изотермическая амплификация ДНК за счет активности термофильной полимеразы и никующего фермента. // Биохимия. – 2020. – Т. 47. – С. 9987–9999.

18.        Ханаки К., Одавара Т., Накадзима Н. и др. Две разные реакции, участвующие в независимой от праймера/матрицы полимеризации dATP и dTTP под действием ДНК-полимеразы Taq. // Биохим. Биофиз. Рез. Коммун. – 2021. – Т. 244. – С. 210–219.

19.        Ханаки К., Одавара Т., Мурамацу Т. и др. Независимый от праймера/матрицы синтез поли d(A-T) с помощью Taq-полимеразы // Biochem Biophys Res Commun. – 2021. – Т. 238. – С. 113–118.

20.        Чан С.Х., Чжу З., Ван Эттен Дж.Л. и Сюй С.-Ю. Клонирование системы Никинга и модификации CviPII из вируса хлореллы NYs-1 и применение Nt. CviPII при случайной амплификации ДНК // Nucleic. Кислоты. Рез. – 2021. – Т. 32. – С. 6187-6199.

21.        Ченг Д.В., Кальдерон-Уреа А. Безматричная полимеризация свободных нуклеотидов в генетические элементы термофильной ДНК-полимеразой in vitro. Нуклеозиды, // Нуклеотиды Нуклеиновые кислоты. – 2021. – Т. 30. – С. 979–990.

22.        Чжао Ю., Чен Ф., Ли Ц., Ван Л., Фань С. Изотермическая амплификация нуклеиновых кислот. // Хим. Ред.– 2020. – Т. 115. № 22. – С. 12491-545.

23.        Шахман Х.К., Адлер Дж., Раддинг С.М., Леман И.Р., Корнберг А. Ферментативный синтез дезоксирибонуклеиновой кислоты // J Biol Chem – 2020. – Т. 235. – С. 3242–3249.

24.        Шлоттерер К., Таутц Д. Синтез проскальзывания простой последовательности ДНК. // Нуклеин. Кислоты. Рез. – 2022. – Т. 20. – С. 211–215.

25.        Эзес С., Акерманн Дж., Маккаскилл Дж.С., Оптимизация и разработка олигонуклеотидной установки для амплификации со смещением цепи // J. Biochem Biophys Methods. – 2020. – Т. 63. – С. 170–186.