В современной экономике России происходят сложные процессы, связанные с формированием инновационного потенциала, которые первую очередь затрагивают предприятия, организации и бюджетные учреждения. При управлении инновационной деятельностью организаций реализуются типовые функции, в рамках операционной деятельности, такие как: планирование, учет, организация, контроль, анализ и регулирование. Но для эффективного управления инновационным потенциалом необходима объективная, полная и своевременная информация об изменениях, происходящих на управляемом объекте. Получение такой информации всеми участниками инновационных процессов возможно на основе создания системы экономического анализа и мониторинга инфраструктуры организации или учреждения. Экономический анализ и мониторинг может дать органам управления необходимую информацию для принятия объективных управленческих решений для обеспечения устойчивого развития инновационного потенциала организаций и исследуемых бюджетных учреждений.
Актуальность выбранной темы исследования заключается в том, что состав инновационного потенциала существенно зависит от основополагающих характеристик самой инновационной системы, так как инновационная инфраструктура производственных и торговых организаций, отличается от инновационного потенциала бюджетных учреждений весьма значительно. При этом востребованной на практике является система оперативного управления инновационным потенциалом бюджетного учреждения, как по источникам доходов так и по направлениям расходов.