Современные проблемы информатики

Под этим подразумевается, с его слов, оригинальный код по большей степени. 

В отчёте не обязательно прям расписывать теоретическую часть. 

Для каждого шифра нужна и реализации дешифратора.

С его слов, код — не приложение к отчёту, что странно, а его часть, которая идёт после описания небольших шагов действий, объяснений или комментариев, которые объяснят получившийся код

Конечно, в отчёте должны быть скриншоты, показывающие, что код работает