клиент-серверное приложение

Клиент на мобильной флешке на убунте шифрует файл кузнечиком(или любым аналогом) и кодирует информацию младшим битом, передает на сервер. на сервере извлекается и расшифровывается

дополнительно туда нужен протокол распределения ключей (того же Диффи-Хеллмана или на выбор). всё можно реализовать на готовых библиотеках