Можно использовать любую тему.
Склоняюсь к конфигурации "управление задачами", типа Service Desk, когда пользователи пишут заявку на почту, автоматический регистрировалась по ключевым словам в 1С. (как пример)
Дипломная работа должна состоять из 3-4 глав
Первая о предприятии (можно пропустить)
Второе о программе
Третье "Инструкция пользователя", где по шагам расписано, куда нажать, где нажать